如何成功在Linux系统中安装R软件?

在 Linux 系统上安装 R 软件,可以通过几种不同的方法进行,以下是详细的步骤和说明:

通过源码编译安装 R

如何成功在Linux系统中安装R软件?插图1
(图片来源网络,侵删)

1、下载安装包

使用wget 下载 R 的源码包,下载 R-3.6.2 版本:

```bash

wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.6.2.tar.gz

```

如何成功在Linux系统中安装R软件?插图3
(图片来源网络,侵删)

2、解压文件

使用tar 命令解压下载的文件:

```bash

tar -xzvf R-3.6.2.tar.gz

```

如何成功在Linux系统中安装R软件?插图5
(图片来源网络,侵删)

3、进入解压目录

切换到解压后的 R 源码目录:

```bash

cd R-3.6.2

```

4、构建目录

创建 R 的安装目录:

```bash

mkdir -p /home/work/R

```

5、配置和编译

运行./configure 脚本,并指定安装前缀:

```bash

./configure --prefix=/home/work/R --enable-R-shlib

```

6、安装

编译并安装 R:

```bash

make

sudo make install

```

7、配置环境变量

编辑~/.bash_profile 文件,添加 R 的路径:

```bash

vi ~/.bash_profile

```

添加以下内容到文件末尾:

```bash

export PATH=${HOME}/R/bin:$PATH

```

使配置生效:

```bash

source ~/.bash_profile

```

8、验证安装

在终端输入R,如果成功进入 R 控制台,则表示安装成功。

通过包管理器安装(以 Ubuntu 为例)

1、更新软件包列表

```bash

sudo apt update

```

2、安装 R

使用apt 命令安装 R:

```bash

sudo apt install r-base

```

通过 Conda 安装 R

1、安装 Miniconda 或 Anaconda

从 [Miniconda](https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html) 或 [Anaconda](https://www.anaconda.com/products/individual) 官网下载并安装适合你的 Linux 发行版的版本。

2、创建虚拟环境

打开终端,创建一个新的 Conda 环境:

```bash

conda create -n myenv r-essentials

```

3、激活虚拟环境

激活新创建的环境:

```bash

conda activate myenv

```

4、安装 R

在激活的环境中安装 R:

```bash

conda install r-base

```

安装 RStudio(可选)

1、下载 RStudio

从 [RStudio 官网](https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/#download) 下载适用于 Linux 的 RStudio 安装包。

2、安装 RStudio

使用dpkg 命令安装下载的.deb 文件:

```bash

sudo dpkg -i rstudio-xenial-amd64.deb

```

安装 R 包

1、使用install.packages()

在 R 环境中,使用以下命令安装包:

```R

install.packages("packagename")

```

2、使用BiocManager 安装 Bioconductor 包

如果使用的是较新的 R 版本,可以使用BiocManager

```R

install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("packagename")

```

3、本地安装包

如果包已经下载到本地,可以使用以下命令安装:

```R

install.packages("path/to/package.tar.gz", repos = NULL, type = "source")

```

卸载 R 包

1、使用remove.packages()

在 R 环境中,使用以下命令卸载包:

```R

remove.packages("packagename")

```

查看 R 及其包的版本

1、查看 R 版本

在 R 环境中,使用以下命令查看 R 版本:

```R

version

```

或者:

```R

R.version

```

2、查看已安装的包及其版本

在 R 环境中,使用以下命令查看已安装的包及其版本:

```R

installed.packages()[, c(1, 3)]

```

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