在Linux环境下安装和使用R语言,可以通过以下步骤进行:
R语言的安装与配置
1、下载安装包:
通过wget命令下载R语言的安装包,wget http://lib.statNaNu.edu/R/CRAN/src/base/R-3/R-3.1.2.tar.gz
。
或者使用apt管理工具直接安装最新版本的R语言,如Ubuntu系统下可执行:sudo apt update && sudo apt install r-base
。
2、解压文件:
使用tar命令解压下载的R语言安装包,tar xzf R-3.1.2.tar.gz
。
3、进入R源文件所在目录:
使用cd命令进入解压后的R源文件目录,cd R-3.1.2
。
4、构建目录并配置环境变量:
创建R语言的安装目录,如:mkdir -p /home/work/R
。
运行./configure脚本进行配置,./configure --prefix=/home/work/R --enable-R-shlib
。
安装R语言,执行make和make install命令。
配置环境变量,编辑.bash_profile文件,添加R语言的bin目录到PATH环境变量中,然后重新登录或执行source命令使配置生效。
5、测试安装:
在shell下输入R命令,如果能够打开R环境,则说明安装成功。
R包的安装与卸载
1、安装R包:
使用install.packages()函数从CRAN镜像站点安装R包,install.packages("mypackage")
。
如果需要安装本地下载的R包,可以使用R CMD INSTALL命令或在install.packages()函数中指定本地文件路径和参数。
Bioconductor项目的R包可以通过source()函数和biocLite()函数进行安装。
2、卸载R包:
使用remove.packages()函数卸载指定的R包,remove.packages("mypackage")
。
3、查看R及其包的版本:
使用version或R.version命令查看R的版本信息。
使用packageVersion()函数查看已安装R包的版本信息。
R语言的基础操作
1、向量和矩阵操作:
使用c()函数创建向量,length()函数获取向量长度,mode()函数获取向量中数据的类型。
使用rbind()和cbind()函数将多个向量或矩阵合并为一个矩阵。
2、数学运算:
使用mean()函数求平均值,sum()函数求和等。
3、帮助系统:
使用help()函数阅读在线帮助文件,help.start()函数通过HTML浏览器查看帮助文件。
4、脚本编写与执行:
编写R脚本文件(如t.R),使用Rscript命令执行脚本文件。
步骤可能因Linux发行版和R版本的不同而有所差异,在实际操作中,请参考最新的官方文档或社区指南以获取最准确的信息,确保在进行任何系统级操作前备份重要数据以防万一。
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